Il programma annuale controllo acque è un documento che viene predisposto dalla Direzione di Area, con la supervisione della Direzione Tecnica, che stabilisce, sulla base dello schema idrico esistente, delle contingenze occorse nei 12 mesi precedenti, degli accordi istituzionali con gli enti preposti, il numero dei prelievi da effettuare durante l’anno successivo, determina i luoghi dove tali prelievi devono essere effettuati e la loro periodicità.